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Cell頭條:首張人類可溶性蛋白復(fù)合物圖譜
更新時間:2012-10-08   點擊次數(shù):1370次

來自加拿大多倫多大學(xué),英國倫敦大學(xué)的研究人員采用了一種綜合性整體蛋白質(zhì)組分析方法,構(gòu)建了三千多個人可溶性蛋白之間多達上萬個高可信度的物理相互作用,這添補了之前科學(xué)家們對于人類蛋白復(fù)合物知之甚少的空白,為深入了解核心生物進程提供了重要信息。相關(guān)成果公布在Cell雜志上。

領(lǐng)導(dǎo)這項研究的是包括多倫多大學(xué)的Andrew Emili在內(nèi)的三位蛋白研究專家,他們其中有的曾構(gòu)建過釀酒酵母蛋白復(fù)合物圖譜,有的研發(fā)過新型的細胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究新方法。

對于這一研究新成果,來自美國西北大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Sui Huang(未參與這一研究)評價道,“這篇文章包含了大量的工作,系統(tǒng)地識別了人類細胞中可溶性蛋白之間的的物理作用。獲得了一個非常有用的數(shù)據(jù)庫,可以通過這個數(shù)據(jù)庫搜索體外和體內(nèi)某種蛋白經(jīng)測試的相互作用。這個數(shù)據(jù)庫令人驚嘆,雖然它可能不完整,但對于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域來說,這是一個的資源。”

細胞過程往往依賴于蛋白質(zhì)之間穩(wěn)定的物理相互作用。近年來在這一方面取得了不少成功,但是關(guān)于人類蛋白質(zhì)復(fù)合物的組成,科學(xué)家們?nèi)匀涣私獾暮苌佟?/p>

為了添補這一空白,研究人員采用一種綜合性整體蛋白質(zhì)組分析方法,通過色譜分離,將培養(yǎng)的人類細胞分離成為超過一千份的生化組分,然后利用定量串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)進行分析,從而系統(tǒng)識別出了一個由3,006個穩(wěn)定的,可溶性的人類蛋白之間13,993個高可信度相互作用組成的網(wǎng)絡(luò)圖譜。

關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法,“一些科學(xué)家指出,蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性是無限的”,來自美國巴克老年研究所(Buck Institute for Age Research )Bradford Gibson解釋道,像是剪切變化,磷酸化修飾,蛋白表達時序變化,蛋白翻轉(zhuǎn),以及蛋白相互作用,都是造成蛋白質(zhì)組復(fù)雜的原因。盡管蛋白質(zhì)組存在許多變化,但現(xiàn)代的高技術(shù)圖譜也能幫助科學(xué)家們更好的了解細胞中的一舉一動。具體的技術(shù)內(nèi)容:蛋白質(zhì)組技術(shù):各類質(zhì)譜方法優(yōu)缺點

另外蛋白質(zhì)組學(xué)研究產(chǎn)品也有了進展,賽默飛世爾的Thermo Scientific離子阱、三重四極桿和以O(shè)rbitrap為基礎(chǔ)的質(zhì)譜儀近期在蛋白質(zhì)組學(xué)研究中取得了一些重要進展:提高大規(guī)模top-down蛋白質(zhì)組學(xué)研究中產(chǎn)生的信息量,提高同量異序標記方法的定量準確性,提高糖蛋白質(zhì)組學(xué)效率,并加速目標定量研究的步伐。具體可以點擊此處索取更多資料。

研究人員發(fā)現(xiàn)的622個假定蛋白復(fù)合物中,大部分與核心生物進程有關(guān),其中還有兩個候選疾病基因,以及未注釋的蛋白作用機制。更引人注目的是,大型的多蛋白組件更多的被注釋分析,進化上也更保守,而只帶有5個,或者更少亞基的人類蛋白復(fù)合物被解析的更少,而且也僅僅在脊椎動物中出現(xiàn),這表明進化上近期出現(xiàn)過功能革新。

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