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噬菌體裝配機(jī)制
更新時(shí)間:2010-12-07   點(diǎn)擊次數(shù):2916次

噬菌體裝配可以分為5個(gè)階段:前起始、起始、延伸、前終止和終止。前起始定義為形成一個(gè)組裝位點(diǎn),一個(gè)在電鏡下可見的區(qū)域,在這里質(zhì)膜和外膜緊密相連。組裝位點(diǎn)由3個(gè)形態(tài)蛋白組成,分別是p工蛋白、pⅪ蛋白和pⅣ蛋白,這些蛋白通過其周質(zhì)區(qū)相互作用(pⅣ蛋白的N端、p工蛋白的C端,以及可能的pⅪ蛋白的C端);組裝位點(diǎn)的形成與噬菌體其他蛋白無關(guān)。

 
    pⅣ蛋白在中央形成一個(gè)直徑約8nm的圓柱狀結(jié)構(gòu)的空洞;它由12~14個(gè)相同的亞基組成,總分子質(zhì)量約為600kDa。在冷凍蝕刻電鏡下(MR等,未發(fā)表數(shù)據(jù)),在空洞中央有一定的密集性物質(zhì),這可能解釋了為什么pⅣ通道在常態(tài)下呈關(guān)閉狀態(tài)。但是,一些pⅣ蛋白的變異形式能夠經(jīng)常性地開啟,并使外源性物質(zhì)進(jìn)入細(xì)菌周質(zhì)區(qū)。因缺少pⅢ蛋白而無法由細(xì)胞中釋放出的噬菌體可以阻止外源物質(zhì)的進(jìn)入,說明噬菌體確實(shí)是經(jīng)由pⅣ通道釋放出的。對(duì)于pⅣ通道的內(nèi)部所知甚少,只知道它可以容納IKe噬菌體的異源性pⅧ蛋白E34],以及N端載有大段延長(zhǎng)片段的特定pⅧ蛋白亞基或者如噬菌體展示那樣N端被替換為短延長(zhǎng)片段(6~8個(gè)殘基)的pⅧ蛋白。pⅣ通道的大小和(或)性質(zhì)可能是影響pⅧ蛋白展示肽段大小的一個(gè)限制因素。
 
    pI和pⅪ也形成多聚體復(fù)合物,每個(gè)復(fù)合物包含各5~6個(gè)拷貝的兩種蛋白;該復(fù)合物的形狀和大小未知(J.N.Feng,P.Model和M.R.,未發(fā)表數(shù)據(jù))。在沒有其他蛋白的條件下,pI/pⅪ可以使細(xì)胞膜去極化,這表示這個(gè)復(fù)合物很可能也是一個(gè)通道。所以裝配位點(diǎn)很可能是一個(gè)極大的橫跨細(xì)菌內(nèi)外膜的通道。pI蛋白N端胞質(zhì)區(qū)(pⅪ蛋白無此結(jié)構(gòu)域)包含一個(gè)保守的核苷酸結(jié)合功能域;由于噬菌體裝配需要水解ATp,pI蛋白很可能是一個(gè)ATP水解酶。
 
    僅當(dāng)裝配位點(diǎn)[兩個(gè)次要衣殼蛋白(pⅦ和pⅨ)]到達(dá)顆粒的末端并且單鏈DNA底物存在時(shí),噬菌體裝配才被起始。遺傳學(xué)分析顯示出pⅦ蛋白和pⅨ蛋白(位于膜上)可與突出于pV—ssDNA復(fù)合物(位于胞質(zhì))一端的包裝信號(hào)相互作用,并且包裝信號(hào)可與pI蛋白胞質(zhì)區(qū)結(jié)合。宿主細(xì)胞編碼的一個(gè)小的、被認(rèn)為是潛在的蛋白二硫鍵還原酶的胞質(zhì)蛋白——硫氧化還原蛋白,也可以和pI蛋白相互作用。盡管噬菌體的裝配不需要這樣的還原活性,硫氧化還原蛋白看來還是裝配起始復(fù)合物的一部分,并且可能和延伸反應(yīng)的過程有關(guān)。
 
    延伸的過程包括位于膜上的pⅧ蛋白替換與病毒DNA結(jié)合的pV蛋白二聚體,以及轉(zhuǎn)運(yùn)DNA穿過細(xì)胞膜。這個(gè)過程一直延續(xù),直到病毒DNA的末端都被pⅧ蛋白結(jié)合。在pⅢ和pⅥ蛋白都不存在的條件下,大的胞外噬菌體顆粒仍然會(huì)連接在質(zhì)膜上,并當(dāng)有pV—ssD—NA復(fù)合物進(jìn)入裝配位點(diǎn)時(shí),繼續(xù)延伸過程,zui后連接的噬菌體會(huì)形成10倍以上的單位長(zhǎng)度。就算是在正常感染即當(dāng)pⅢ和pⅥ蛋白都存在的條件下,大約有5%的子代噬菌體顆粒有兩倍長(zhǎng)度。這種再延伸過程不需要重起始——即使是沒有裝配信號(hào)的單鏈DNA也能有效地被并入。
 
    前終止過程是一個(gè)將膜上的pⅢ—pⅥ蛋白復(fù)合物整合到新生噬菌體顆粒上的過程。一個(gè)含有pⅢ蛋白C末端83個(gè)殘基的片段足以調(diào)節(jié)這個(gè)步驟,但是卻無法使噬菌體顆粒從細(xì)胞上脫落下來。終止過程需要pⅢ蛋白C末端93個(gè)殘基的片段,通過該片段的構(gòu)象變化,使得pⅢ一pⅥ蛋白復(fù)合物解離,進(jìn)而使噬菌體從質(zhì)膜上脫離c13J。更長(zhǎng)的pⅢ蛋白部分(132個(gè)C末端殘基的片段)是形成穩(wěn)定的噬菌體顆粒所必要的。
 

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